人類基因組中發(fā)現(xiàn)新的突變熱點(diǎn)
記者張夢(mèng)然
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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)人類基因組中存在一類特別容易發(fā)生突變的新區(qū)域,這些區(qū)域位于基因的起始點(diǎn),也就是轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)。這些DNA片段的改變可以遺傳給后代,對(duì)人們理解遺傳學(xué)和疾病的發(fā)生具有重要意義。該成果由西班牙巴塞羅那基因組調(diào)控中心主導(dǎo),發(fā)表在最新一期《自然·通訊》上。
此次發(fā)現(xiàn),基因起始點(diǎn)之后的前100個(gè)堿基對(duì)比偶然發(fā)生突變的概率高出35%。這些序列是細(xì)胞機(jī)制開始將DNA復(fù)制成RNA的起點(diǎn),因此是基因組中功能最重要的區(qū)域之一,與蛋白質(zhì)編碼序列同等重要。這些序列極易發(fā)生突變,是整個(gè)人類基因組中功能最重要的區(qū)域之一。
研究顯示,許多額外的突變發(fā)生在受孕后的最初幾輪細(xì)胞分裂中,這些突變被稱為鑲嵌突變,即只出現(xiàn)在某些細(xì)胞中,而非所有細(xì)胞。這也是這些突變熱點(diǎn)長(zhǎng)期以來(lái)未被發(fā)現(xiàn)的部分原因。父母可能攜帶這些鑲嵌突變而無(wú)癥狀,因?yàn)橥蛔儍H存在于某些細(xì)胞或組織中,但這些突變?nèi)钥赡芡ㄟ^(guò)卵子或精子傳遞給后代。如果孩子所有細(xì)胞都攜帶該突變,就可能導(dǎo)致疾病。
團(tuán)隊(duì)通過(guò)對(duì)英國(guó)生物庫(kù)中15萬(wàn)個(gè)人類基因組和7.5萬(wàn)個(gè)基因組的轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)進(jìn)行分析,并與11個(gè)獨(dú)立家族研究中的鑲嵌突變數(shù)據(jù)進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)了這一現(xiàn)象。而許多基因的起始位點(diǎn)發(fā)生了異常多的突變,尤其是與癌癥、腦功能和肢體發(fā)育缺陷相關(guān)的基因起始點(diǎn)受影響最為嚴(yán)重。
當(dāng)觀察更古老、更常見(jiàn)的變異時(shí),這種額外的突變現(xiàn)象減少,表明自然選擇正在過(guò)濾掉這些有害突變。換句話說(shuō),那些基因起始位點(diǎn)帶有突變的家族,尤其是與癌癥和腦功能相關(guān)的基因,更不容易將這些突變遺傳下去,經(jīng)過(guò)幾代人這些突變逐漸消失。
目前,遺傳學(xué)家使用突變模型來(lái)判斷在基因組特定區(qū)域如果沒(méi)有特殊情況時(shí),預(yù)計(jì)會(huì)出現(xiàn)多少突變。臨床上,該基線用于確定哪些變異應(yīng)被關(guān)注,哪些應(yīng)被優(yōu)先考慮。然而,如果模型不知道自然突變熱點(diǎn),就可能得出錯(cuò)誤結(jié)論。例如,模型可能預(yù)期某個(gè)區(qū)域有10個(gè)突變,但實(shí)際上觀察到50個(gè),而正確的基線可能是80個(gè),這一盲點(diǎn)正是此次突破的重點(diǎn)。
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